近5年来，长江委水文局不断优化水质监测站网，配合西部大开发和丹江口大坝加高工程，增设了嘉陵江、万州2个水质监测分中心，新增了华弹、陶岔等36个水质监测断面，同时在三峡库区开展水温分层监测，拟定了库区干流42个水功能区监测断面和10条库湾监测断面。水质监测站点由2000年的76个发展到2005年的112个，开展了省界水体水质监测，拓展水质监测项目19项。在水质监测设施设备的投入上，5年累计投入1500多万元，改造了3个水质分析实验室，7个水环境监测中心先后配备了先进的水质分析仪，并获得国家级计量认证合格证书。在水环境监测方面，除完成常规监测外，还完成了长江三峡工程生态与环境监测系统——水量水质同步监测子系统监测、长江干流主要城市近岸水域及入江排污口调查监测、长江口水量水质同步调查监测等，以及汉江“水华”预测预报、三峡水库蓄水后库区水温影响分析。开展了包括汉江“水华”、沱江特大氨氮水污染、重庆垫江化工厂爆炸苯泄漏在内的突发性水污染事件的调查监测与报告34次。

    长江委水文局局长魏山忠认为，在强化合理开发利用长江水资源、保护生态环境的过程中，需要制定水资源规划、水资源中长期供求规划、实施取水许可制度等，而这些工作的开展和制度的实施，必须依据及时可靠的水量水质监测信息。重要调水、供水工程、重大水事活动，都要求我们加强对水资源和生态与环境变化情况的动态监测。健康长江需要维持江河的合理流量和湖泊、水库以及地下水的合理水位；江段水域需要在水体的自然净化能力前提下核定水域的纳污能力，等等，这些也都需要加强水量水质信息的及时监测